李在明可能是韩国历史上最厉害的总统之一，因为他亲手终结了韩总统的“心腹大患”——韩国检察厅。熟悉韩国历史的人都知道，韩国历届总统，基本都是被韩国检察厅拿下的。
李在明担任京畿道知事期间曾面对检察厅五项主要指控，内容包括地产开发项目、土地变更和资金使用，以及2021年竞选期间的相关陈述。这些调查覆盖侦查到起诉全流程，直接影响他的政治活动。
2025年6月就任总统后，李在明政府将检察改革列为首要任务。7月初执政党与总统办公室开始讨论，目标是拆分检察厅集侦查权和起诉权于一身的体制。9月7日行政安全部长官和共同民主党政策委员会议长公布政府组织改组方案，明确废除检察厅，设立隶属行政安全部的重大犯罪调查厅负责重大犯罪侦查，以及隶属法务部的公诉厅负责公诉事务。方案还涉及预算职能调整以分散权力。
方案公布后政府启动人事调整，前任政府时期与尹锡悦关系密切的高层检察官陆续离开核心岗位。首尔中央地方检察厅等部门关键人员或辞职或调离，检察总长也在短时间内离任。这些变动为改革减少了内部阻力。
9月26日国会全体会议在在野党议员退席情况下以174票赞成1票反对通过《政府组织法》修正案。修正案规定改革自公布一年后施行，即2026年9月正式实施。1948年设立的检察厅运行78年后将不复存在。
改革后侦查工作由重大犯罪调查厅独立开展，起诉需公诉厅审查同意，两部门分属不同部委并相互监督。单一机构无法独自完成立案到起诉全链条，也难以独立对高层住所采取行动。
同时李在明政府对前总统尹锡悦夫妇展开特别检察调查。尹锡悦曾在检察系统任职多年，包括检察总长职位，任内安排亲信进入要害部门。其夫人涉嫌股价操纵案件此前检方曾作出不起诉决定，现在在改革框架下继续审查。
这一改革回应了韩国社会对检察权集中的长期批评。过去文在寅政府等曾尝试分离权力但未彻底成功。李在明政府凭借国会多数优势推进，法案通过后相关部门讨论公诉厅补充侦查权等细节，确保新体制运行。改革完成后韩国司法体系权力分布发生结构性变化。
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